香港大学环境工程硕士学位课程创立于1970年，旨在提供先进的环境工程的各个领域的教育。为了满足日益增长的进一步的专业化的需求，自1998年起原香港大学环境工程硕士课程渐渐被单独的环境工程具体方向的工程硕士学位课程所取代。自2002年起，香港大学开设了环境工程授课式硕士学位课程，旨在为学生提供环境工程学科深入的理论与实践培训。