纽约市立学院化学工程系研究生阶段开设有ME和Ph.D项目:
化学工程理学硕士:纽约市立学院化学工程理学硕士项目要求学生完成30个学分,且全日制学生需参与研究。
化学工程哲学博士:纽约市立学院化学工程哲学博士项目旨在培养出色的化学工程师,帮助学生为未来在研究开发、产品开发、工厂的设计、运行、销售和用户支持以及管理等行业的职业发展打下坚实基础。并且,纽约市立学院化学工程哲学博士项目的教师团队拥有丰富的学术资源,其研究项目得到了资金支持,内容涵盖9个不同领域,涉及纳米结构自组装蛋白的设计和清洁燃料的开发等内容,学生将有机会与教师合作进行研究,提升自己的研究能力。